多克隆抗體的第一步和單克隆抗體一樣，都是將免疫原注射到宿主體內產生免疫反應，激活了多種B細胞。不同的是免疫過后，多克隆抗體就直接從免疫宿主的血清中分離出來，或接著進行純化，沒有與骨髓瘤細胞融合的過程。一旦宿主動物死亡，需要免疫新的動物，這時血清中的抗體就會有所不同。雖然多抗每批次有輕微差別，但是因為它識別的表位多，這個差別影響并不算太大，而單克隆抗體雖然價格偏高，可是特異性更強更穩定。可以說單抗和多抗是各有各的優點。
 

　　多克隆抗體更適用于:
 

　　1、檢測有高同源性的抗原的已知或未知同種型
 

　　2、檢測濃度較低的抗原
 

　　3、捕獲盡可能多的抗原 (例如 IP 或 ChiP)
 

　　4、檢測變性的蛋白
 

　　5、檢測可能發生了糖基化或形態變化的目標蛋白
 

　　6、用多種檢測方法檢測一種原蛋白時
 

　　7、檢測 pH 和鹽度不同的溶液中的目標蛋白
 

　　多克隆抗體不建議用于:
 

　　1、量化檢測，比如：流式。由于不同表位的結合導致信號被放大加強，可能會導致結果不準確
 

　　2、當高同源性蛋白的交叉反應會引起問題時